ऑपरेशन सिंदूर पर मोदी सरकार के समर्थन में थरूर मुखर रहे हैं। उन्होंने सांसदों के एक प्रतिनिधिमंडल का नेतृत्व करते हुए अलग-अलग देशों का दौरा किया और आतंकवाद और ऑपरेशन सिंदूर पर भारत के रुख को समझाया। हालांकि, यह कांग्रेस नेतृत्व को रास नहीं आया और लोकसभा में बहस के लिए कांग्रेस के वक्ताओं की लिस्ट में उनका नाम नहीं था